http://www.charmm-gui.org/?doc=input/ligandrm Primero debemos cerciorarnos que el ligando corresponde, y no forma anillos anexos como es el caso, de AS4 dentro del PDB, cargamos Ligand ID as4, y vemos la conformación correcta, para luego seguir al siguiente paso.. Next. Tomamos el ligando AS4, que ahora se llamara LIG comprobamos la estructura del ligando Does not show […]
Laboratorio de Simulaciones Moleculares Computacionales, Facultad de Ciencias Químicas, BUAP ¿Qué sabe Ud. Acerca de… Dinámica Molecular? What do you know about… Molecular Dynamics? Preguntas 1. ¿Qué es la Dinámica Molecular? 2. ¿Qué tipo de información se requiere para realizar un estudio por Dinámica Molecular? 3. ¿Qué diferencia existe entre la Dinámica Molecular y otros […]
Tunnels and channels facilitate the transport of small molecules, ions and water solvent in a large variety of proteins. Characteristics of individual transport pathways, including their geometry, physico-chemical properties and dynamics are instrumental for understanding of structure-function relationships of these proteins, for the design of new inhibitors and construction of improved biocatalysts. CAVER is a […]
