Aquí os incluímos una serie de páginas web que incluyen una utilidad para comprobar si la coadministración de algunos fármacos tiene algún tipo de interacción. Drug Interaction Checker (de Medscape): AQUIHerramienta que analiza si hay interacciones relevantes. Solo especifica las relevantes, en principio por la experiencia al usarlo, se omiten las interacciones de carácter teórico.Necesita Registro […]
Autor: SCOTTxRT
LigandScout mapas de interacción.
Farmacoforos, y residuos con mayor participación . obtencion del mapa de interaccion
Uso VMD, NAMD ENERGY
Calculo de Energias VDW, y Elec. Es necesario poseer .psf .pdb .dcd. y especificar los 2 componentes a medir. Basic Usage NAMDEnergy operates on either one or two selections; if only one selection is chosen, then internal energies for that selection will be calculated, whereas if two selections are chosen, only interaction energies between those […]
VMD Distance Measurements of a Simulation in NAMD
uso se carga el script, con source distance.tcl y luego Se necesita modificación en el uso de las comas/puntos para que la importacion de datos en excel sea mas expedita.Edición pendiente.
¿La eplerenona es menos ahorrador de potasio que espironolactona?
¿ Cual es su indicación en insuficiencia cardíaca? Al revisar la ficha técnica de la Agencia Española de Medicamentos (1), la evaluación del fármaco en DrugDex(2), o los boletines de evaluación de varios servicios autonómicos(3,4), la indicación de empleo de la eplerenona se sitúa en pacientes con insuficiencia cardíaca por disfunción ventricula rizquierda como complicación de un infarto agudo de miocardio(IAM). […]
(Chemistry at HARvard Macromolecular Mechanics)
CHARMM Es un programa de simulación molecular aplicable a una gran variedad de sistemas conformados por cantidades considerables de partículas, con un conjunto integral de funciones de energía, variedad en métodos de muestreo mejorados y soporte para técnicas de múltiples escalas que incluyen QM / MM, MM / CG y una gama de modelos de […]
2AAX with HCY vs 2AA2 with AS4 molecular dynamics
Calculos de strides optimos para los 50.000.000 frames, a los 100 ns. = 4 . Lo que da resultado 2500 frames Alineacion RMSD, desde protein.2AAX with HCY RMSD, desde protein.2AA2 with AS4 Resultados RMSD, desde ligand 2AAX with HCY Resultados RMSD, desde ligand 2AA2 with AS4
Links estudio
http://usuarios.nlhpc.cl/index.php/Lmod https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.11/notes.html http://usuarios.nlhpc.cl/index.php/Lmod https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.10/ug/node84.html http://usuarios.nlhpc.cl/index.php/SLURM https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/mailing_list/namd-l.2015-2016/1054.html https://www.nvidia.com/es-es/data-center/gpu-accelerated-applications/namd/ https://scitas-data.epfl.ch/confluence/display/DOC/How+to+launch+NAMD