Dinamica molecular

2AAX with HCY vs 2AA2 with AS4 molecular dynamics

Posted on Author SCOTTxRT Comment(0)

Calculos de strides optimos para los 50.000.000 frames, a los 100 ns. =
4 . Lo que da resultado 2500 frames

2AAX with HCY
2AA2 with AS4

Alineacion RMSD, desde protein.
2AAX with HCY

RMSD, desde protein.
2AA2 with AS4

Resultados RMSD, desde ligand
2AAX with HCY

Resultados RMSD, desde ligand
2AA2 with AS4

Related Articles
Dinamica molecular

TEST CCgenFF with Bencene molecule parte II con CHARMM-GUI

Posted on Author SCOTTxRT

Se utilizó http://www.charmm-gui.org/?doc=input/pdbreader donde se agrego una molécula de benceno, con sus hidrogenos en formato PDB leyo la informacion del […]
Dinamica molecular

Molecular Visualization and Simulation in VR

Posted on Author SCOTTxRT

http://www.ks.uiuc.edu/Research/gpu/files/IUVR-VMD-Stone.pdf
Dinamica molecular

Force field comparison: Amber, GROMOS, CHARMM, OPLS

Posted on Author SCOTTxRT

Agregar un comentario

Tu dirección de correo electrónico no será publicada. Los campos requeridos están marcados *