La unión entre aminoácidos se establece mediante enlaces peptídicos, que son enlaces covalentes de tipo amida entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el grupo amino de otro.
Este enlace presenta unas características especiales de gran importancia para la estructura de las proteínas:
- Es un enlace covalente más corto que otros enlaces C–N, lo que se explica por las diferencias de electronegatividades y a su resonancia:
- El enlace C–N carácter parcial de doble enlace, con una longitud de 1´32 Å, intermedia entre el enlace sencillo (1’49 Å) y doble (1’27 Å). Su geometría se parece a la de una hibridación sp2. Por tanto, el enlace peptídico no puede girar libremente.
- Los cuatro átomos del grupo peptídico y los dos átomos de carbono se hallan situados sobre un mismo plano, manteniendo distancias y ángulos fijos.
El enlace peptídico es, por tanto, un enlace plano y rígido e impone una serie de restricciones que afectarán a la conformación que adoptará cada proteína.