http://www.charmm-gui.org/?doc=input/ligandrm
Primero debemos cerciorarnos que el ligando corresponde, y no forma anillos anexos como es el caso, de AS4 dentro del PDB, cargamos Ligand ID as4, y vemos la conformación correcta, para luego seguir al siguiente paso.. Next.
![](https://i.imgur.com/ZFftIGN.png)
Tomamos el ligando AS4, que ahora se llamara LIG
![](https://i.imgur.com/oARjFue.png)
![](https://i.imgur.com/yMQmElb.png)
comprobamos la estructura del ligando
![](https://i.imgur.com/NFMEo9L.png)
Does not show extra ring ,
the modification has been successful
The solution builder.
![](https://i.imgur.com/XRa91XY.png)
![](https://i.imgur.com/cUYRKxF.png)
Se carga el ligando LIG y se agrega la mutacion
Mutation
![](https://i.imgur.com/TZMW8vq.jpg)
La lógica aplicada es, existía una CYS, la cual se muto a SER, así que volveremos esa SER a CYS
![](https://i.imgur.com/WxmffbX.png)
![](https://i.imgur.com/brLDrat.png)
![](https://i.imgur.com/C9tmnoH.png)
![](https://i.imgur.com/6qbq7MA.png)
resultados
https://www.dropbox.com/sh/y48qxwtsm4ttipf/AABCaeQgCeYpUcaHvKBg3awGa?dl=0