ver_ http://www.ks.uiuc.edu/Research/gpu/files/siam2019-softnextgenplatforms-stone.pdf
LigandScout mapas de interacción.
Farmacoforos, y residuos con mayor participación . obtencion del mapa de interaccion
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TEST CCgenFF with Bencene molecule parte II con CHARMM-GUI
Se utilizó http://www.charmm-gui.org/?doc=input/pdbreader donde se agrego una molécula de benceno, con sus hidrogenos en formato PDB leyo la informacion del mismo luego Nos da esta informacion, donde buscamos el CSML, para ver si existen los parametros para esta molecula. Nos dice que esta, de dos formas la forma BENZ y la forma CHXE Asi que […]
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TEST CCgenFF with Bencene molecule
Este es un test del uso de CCgenFF con una molecula simple de benceno. Antes se utilizo esta herramienta pero presento problemas, retomare para ver si he pasado por alto algunos detalles que antes desconocia. Lo primero que pide es una molecula en formato .mol2 con todos los hidrogenos agregados, esto lo realice con […]