Dinamica molecular

Procedimiento DM MR/adosterona.

http://www.charmm-gui.org/?doc=input/ligandrm

Primero debemos cerciorarnos que el ligando corresponde, y no forma anillos anexos como es el caso, de AS4 dentro del PDB, cargamos Ligand ID as4, y vemos la conformación correcta, para luego seguir al siguiente paso.. Next.

Tomamos el ligando AS4, que ahora se llamara LIG


comprobamos la estructura del ligando


Does not show extra ring ,
the modification has been successful

The solution builder.

Se carga el ligando LIG y se agrega la mutacion

Mutation

La lógica aplicada es, existía una CYS, la cual se muto a SER, así que volveremos esa SER a CYS

resultado
equilibration
production

resultados

https://www.dropbox.com/sh/y48qxwtsm4ttipf/AABCaeQgCeYpUcaHvKBg3awGa?dl=0

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